ГБУЗ Московский научно-исследовательский институт организации здравоохранения и медицинской экологии (МНИИМЭ) – научное учреждение, созданное в системе Департамента здравоохранения г.Москвы 6 сентября 1994 г. согласно Постановлению Правительства г.Москвы №745 на базе ОАО "Всероссийский научный центр молекулярной диагностики и лечения". Институт был создан «с целью проведения работ по выявлению основных химических и биологических факторов окружающей среды, вызывающих неблагоприятное воздействие на здоровье населения города, осуществления эффективного контроля биологически активных соединений в среде обитания, разработки и производства высокочувствительных и селективных тест-систем и создания новых лекарственных препаратов избирательного действия».
Официально институт зарегистрирован 28 декабря 1994 года, и этот день можно считать днем рождения института.
В октябре 1996 г. Приказом Комитета здравоохранения г.Москвы №1795-к Генеральным директором МНИИМЭ был назначен доктор химических наук, профессор Сергей Евгеньевич Северин, являющийся Генеральным директором МНИИМЭ и по сей день. В 2002 г. он был избран членом-корреспондентом РАМН, с 2009 г. является заведующим кафедрой биологической химии Первого МГМУ им. И.М.Сеченова.
Для успешного решения стоящих перед институтом задач к работе привлечены ученые разных специальностей: биохимики, биологи, химики, генетики, медики. 65 научных сотрудников работает в 4 отделах и 9 лабораториях МНИИМЭ, из них 8 докторов и 39 кандидатов наук.
Отделения: